1352年，那会儿朱元璋刚在濠州参加起义，耿再成便投靠了他，此后便一直效力于朱元璋，忠心耿耿。朱元璋于1368年登基，而耿再成死于1362年。

1353年，耿再成跟随朱元璋攻下了泗州、滁州。之后的1354年到1360的六年间，他骁勇善战、立下无数战功，其中最大的功劳是设伏大败元军，为朱元璋赢得了谈判的资本，保全了割据地滁州。

1362年，元朝降将蒋英杀死了大将胡大海、副元帅李祐之等人，随后叛乱。当时耿再成正在和客人吃饭聊天呢，一听到叛乱，立马召集了身边的将士去迎战，二十人都不到。敌众我寡，耿再成质问道：朝廷有什么负你们的，你们竟然谋反？随后叛军刺中他脖子，耿再成落马时仍骂不绝口，最后被叛军杀死。

耿再成为朱元璋初期巩固地盘作出了巨大贡献，遗憾的是他没有等到朱元璋登基的那一天。1368年正月初四，朱元璋在南京称帝，耿再成被追封为明朝开国功臣，配享太庙。